Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C9orf72Q96LT7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C9orf72Q96LT7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms