Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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SAMD8Q96LT4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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SAMD8Q96LT4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SAMD8Q96LT4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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