Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HDAC11Q96DB2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HDAC11Q96DB2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms