Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TM4SF18Q96CE8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms