Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SDCCAG3Q96C92 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms