Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL2Q969S2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms