Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms