Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRG4Q92954 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms