Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHF3Q92576 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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