Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms