Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ZNF439Q8NDP4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF439Q8NDP4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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