Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RASGEF1AQ8N9B8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1AQ8N9B8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms