Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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TRAPPC6BQ86SZ2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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TRAPPC6BQ86SZ2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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TRAPPC6BQ86SZ2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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