Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STRCQ7RTU9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms