Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHA9Q7RTU4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms