Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BEND4Q6ZU67 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BEND4Q6ZU67 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms