Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBA3EQ6PEY2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms