Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GARNL3Q5VVW2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms