Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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PRAMEF20Q5VT98 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PRAMEF20Q5VT98 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PRAMEF20Q5VT98 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PRAMEF20Q5VT98 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PRAMEF20Q5VT98 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PRAMEF20Q5VT98 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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