Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMPD1Q5SYB0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms