Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KHDC3LQ587J8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms