Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL22Q53GT1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms