Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZBED5Q49AG3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms