Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EDRF1Q3B7T1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms