Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHKAPQ2M3C7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPHKAPQ2M3C7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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