Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC96Q2M329 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms