Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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GEN1Q17RS7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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GEN1Q17RS7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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GEN1Q17RS7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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GEN1Q17RS7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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GEN1Q17RS7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GEN1Q17RS7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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