Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPROQ16827 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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