Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTN1Q16799 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTN1Q16799 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms