Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF239Q16600 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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