Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6AP1Q15904 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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