Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRADDQ15628 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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