Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB39AQ14964 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms