Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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COL9A3Q14050 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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COL9A3Q14050 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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COL9A3Q14050 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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COL9A3Q14050 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL9A3Q14050 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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