Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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