Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LAMB3Q13751 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LAMB3Q13751 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms