Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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