Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAPSNQ13702 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAPSNQ13702 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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