Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC1Q13547 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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