Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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