Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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