Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE3BQ13370 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
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