Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms