Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHAF1AQ13111 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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