Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
STRN3Q13033 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms