Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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BNIP1Q12981 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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BNIP1Q12981 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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BNIP1Q12981 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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BNIP1Q12981 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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BNIP1Q12981 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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BNIP1Q12981 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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BNIP1Q12981 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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BNIP1Q12981 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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BNIP1Q12981 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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