Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIN2AQ12879 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
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