Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms