Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP4Q09028 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms