Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
REG3AQ06141 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
REG3AQ06141 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
REG3AQ06141 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
REG3AQ06141 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
REG3AQ06141 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
REG3AQ06141 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
REG3AQ06141 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
REG3AQ06141 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
REG3AQ06141 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
REG3AQ06141 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms